К сожалению периодонтит может привести к образованию кисты или гранулемы на корне больного зуба. Чаще всего лечение кист и гранулем будет связано с хирургическим вмешательством. Резекция верхушки корня, удаление зуба и полное удаление кисты или гранулемы. Консервативному лечению поддаются только небольшие по размерам гранулемы и кисты. Так как это осложненная форма хронического периодонтита, то и лечение проводится аналогичное лечению периодонтита.